在北京，北京比較生殖醫學科治療效果最好的生殖醫院是北京大學第三醫院，其次是醫學醫院北京協和醫院，北京大學人民醫院也名列前茅。科治北京大學第三醫院生殖醫學中心是療效大陸首例試管嬰兒誕生地，擁有院士級專家，北京比較國際先進輔助生殖技術，生殖科研成果豐碩，醫學醫院科技量值排行榜長期領先。科治北京協和醫院婦科內分泌與生殖中心是療效國家臨床重點專科，憑借百年婦產科經驗，北京比較擅長婦科內分泌和生殖外科疾病，生殖疑難病癥生育力保存成功率高，醫學醫院是科治世界衛生組織合作中心。北京大學人民醫院生殖醫學科在輸卵管阻塞、療效多囊卵巢綜合征等疾病的診療上達到國內領先，擁有先進的設備和科研項目。
第1名： 北京大學第三醫院
北京大學第三醫院生殖醫學中心是中國大陸首例試管嬰兒誕生地，圍繞生殖內分泌和不孕癥疾病開展診療，應用體外常規受精等國際先進輔助生殖技術，擅長診治重度卵巢過度刺激綜合征等疑難病癥，開展宮、腹腔鏡微創手術。團隊有中國工程院院士等學術骨干。特色技術有國際首創的胚胎植入前遺傳學診斷新方法MARSALA。科研成果豐碩，獲多項國家科技進步獎，在2016-2021年度中國醫院科技量值排行榜五年排名第一，2021年獲中國醫院五年總科技量值婦產科學榜首。
第2名： 中國醫學科學院北京協和醫院
中國醫學科學院北京協和醫院婦科內分泌與生殖中心是國家臨床生殖內分泌重點專科，依托百年婦產科經驗，擅長診治月經病、多囊卵巢綜合征、不孕不育、更年期綜合征等婦科內分泌疾病，以及輸卵管病變、子宮內膜異位癥等生殖外科難題，可開展試管嬰兒、人工授精等輔助生殖技術，疑難病癥生育力保存成功率國內領先。團隊經驗豐富，多位專家在國內學術團體任要職。特色技術包括女性全生命周期健康管理、惡性腫瘤生育力保存。擁有先進微創手術設備，為世界衛生組織人類生殖研究合作中心之一。
第3名： 北京大學人民醫院
北京大學人民醫院計劃生育與生殖醫學科成立于2004年，前身為1982年設立的計劃生育專業，可開展女性及男性不孕癥診療、輔助生殖技術（如試管嬰兒、單精子注射等）、計劃生育手術（如無痛人流、宮腔鏡取環等），在輸卵管阻塞、多囊卵巢綜合征等疾病診療達國內領先水平。團隊有員工40余人。特色技術有胚胎植入前遺傳學診斷、宮腔鏡下殘環取出術。擁有層流凈化胚胎實驗室、自動實時動態輸卵管造影儀等設備。是北京市首批通過衛生部人類輔助生殖技術資質認證的機構，主導多項國家級、省部級科研項目。
參考來源： 復旦版《中國醫院綜合排行榜》和《中國醫院專科聲譽排行榜》，并以國家及各地衛健委權威數據為依據。